FAT32文件系統是在win98時代最常用的文件系統。而NTFS文件系統在winxp的時代開始流行，一直持續到現在。它們之間有什麼區別呢？主要有四個方面的區別。

1、兼容性

FAT32文件系統是在1997年的win95第二版系統中，首次被引入使用。對大磁碟的利用比FAT16更強很多。在win98時代被廣泛使用，由於win98系統是當時最好的個人系統。也就造就了FAT32被幾乎所有的操作系統接受，最低都可以兼容使用。所以，FAT32文件系統的兼容性是非常高的。低於32G的U盤如果格式化成這種格式，通用性極好。

而NTFS文件系統是在winxp時代引入的新的網路文件系統。它的大容量支持進一步提高，同時也增加了加密、壓縮等安全性。正因為這些，其他操作系統對它的兼容性就降低了很多。

2、容量支持

FAT32因為是32位的文件系統，每個FAT32的文件表只能管理 2的32次方個扇區，每個扇區的最大容量為512B，所以，分區容量最大不能超過2TB。按照微軟各系統的FAT32默認簇大小來看，在16KB簇時，單卷的最大容量為32GB。詳細可見下圖為微軟官方網站數據。同時，文件長度也只有32位可以表示，所以單個文件也不能超過4GB。

NTFS是新型文件系統。很好地解決了當前容量限制的問題，分區最大容量可以支持到16EB（2的24次方TB）。按照微軟各系統的NTFS默認簇大小來看，在64KB簇時，單卷的最大容量為256TB。詳細見下圖為微軟官方網站的數據；

3、可用性

FAT32文件系統包括引導區、文件分配表區、數據區三大塊。最多只能有四個”主分區”。在win系統比FAT16稍快，在DOS下比FAT16更慢。在文件分配表出問題時，只能通過手動執行Scandisk命令或其他類似工具，去檢查錯誤並將系統備份的FAT文件分配表去覆蓋出問題的文件分配表。

而NTFS中的所有文件是以key-value的形式存儲和組織的，支持快速查找和定位文件，提高了操作系統對文件數據的處理效率。同時，NTFS文件系統是日誌型文件系統。所有對磁碟的修改都會被記錄在事件中。如果發生磁碟文件和內存文件不匹配，NTFS會自動將磁碟文件標記為損壞，並將內存文件寫入到磁碟新的位置，這就實現了NTFS的自動修復功能。大大提高了文件系統可用性。