一、ggcorrplot包
ggcorrplot是一個用於繪製相關矩陣熱圖的R語言包。它是基於ggplot2包的,因此可以輕鬆地進行樣式和主題的自定義。ggcorrplot包的安裝方法如下:
# 安裝ggcorrplot
install.packages("ggcorrplot")
# 載入數據包
library(ggcorrplot)
二、ggcorrplot如何添加星號
星號表示統計學上的顯著性,如果您希望在圖形中顯示,請按照以下步驟進行:
# 設置顯著性閾值為0.05
p.mat = cor_pmat(data, method = "pearson", sig.level = 0.05)
# 將星號添加到相關矩陣的右上角
ggcorrplot(corr = data,
p.mat = p.mat,
hc.order = TRUE,
type="lower",
outline.col = "white",
ggtheme = ggplot2::theme_gray)
三、ggcorrplot參數
ggcorrplot有多個參數可以調整,這裡列出了一些常用參數:
type:
熱圖的類型,可以是”upper”、”lower”或”full”。lab:
標籤的位置,可以是”inside”或”outside”。lab_size:
標籤大小。palette:
顏色使用哪一個調色板。title:
圖形的標題。cor.method:
相關係數計算使用哪一種方法。
# 使用不同的參數調整ggcorrplot
ggcorrplot(corr = data,
type = "lower",
lab = "inside",
lab_size = 3,
palette = "RdYlBu",
title = "Correlation Matrix",
cor.method = "pearson",
ggtheme = ggplot2::theme_gray)
四、ggcorrplot圖例刻度
在ggcorrplot中,可以使用scale_fill_gradient()和scale_color_gradient()函數來自定義圖例的刻度和標籤。
ggcorrplot(corr = data,
type = "lower",
lab = "inside",
lab_size = 3,
palette = "RdYlBu",
title = "Correlation Matrix",
cor.method = "pearson",
ggtheme = ggplot2::theme_gray) +
scale_fill_gradient(low = "white", high = "red", limits = c(-1,1), name = "Correlation") +
scale_color_gradient(low = "white", high = "red", limits = c(-1,1), name = "Correlation")
五、ggcorrplot相關性分析
通過檢查ggcorrplot將相關性矩陣中的相關關係可視化,可以幫助您更好地了解數據,並更好地發現數據中的模式。下面是一個使用ggcorrplot進行相關性分析的示例:
library(PerformanceAnalytics)
data(managers)
# 計算相關係數矩陣
data = as.data.frame(managers)
corr = cor(data)
# 使用ggcorrplot可視化相關性矩陣
ggcorrplot(corr = corr,
hc.order = TRUE,
type="lower",
outline.col = "white",
ggtheme = ggplot2::theme_gray) +
theme(legend.position = "bottom")
六、ggcorrplot添加顯著性
為了在圖形中添加顯著性,需要使用cor_pmat()函數計算一組比較數據的顯著性,並將其作為參數傳遞給ggcorrplot()函數。
# 計算顯著性
p.mat = cor_pmat(data, method = "pearson", sig.level = 0.05)
# 使用ggcorrplot添加顯著性
ggcorrplot(corr = data,
p.mat = p.mat,
hc.order = TRUE,
type="lower",
outline.col = "white",
ggtheme = ggplot2::theme_gray)
七、ggcorrplot 添加顏色框
您可以通過添加ggtitle()和ggbackground()函數來控制ggcorrplot的標題和背景顏色。下面是一個使用ggtitle()和ggbackground()函數的示例:
# 添加顏色框和標題
ggcorrplot(corr = corr,
type = "lower",
lab = "inside",
lab_size = 3,
palette = "RdYlBu",
title = "Correlation Matrix",
cor.method = "pearson",
ggtheme = ggplot2::theme_gray) +
scale_fill_gradient(low = "white", high = "red", limits = c(-1,1), name = "Correlation") +
scale_color_gradient(low = "white", high = "red", limits = c(-1,1), name = "Correlation") +
ggtitle("My Title") +
ggbackground("white")
八、ggcorrplot哪個r版本能用
目前,ggcorrplot可以在R版本3.1.0及更高版本上使用。
九、ggcorrplot繪製相關性熱圖的R語言選取
ggcorrplot是一個非常流行的R語言包,用於繪製相關性熱圖。如果您正在處理相關性數據,請嘗試使用ggcorrplot進行可視化分析。
原創文章,作者:小藍,如若轉載,請註明出處:https://www.506064.com/zh-tw/n/288448.html