Slurm:高性能計算管理系統

Slurm是一個用於Linux和Unix操作系統的開源的、可擴展的和高性能的計算集群管理系統,可以用於管理數千個節點。Slurm設計用於管理計算機集群,特別是高性能計算(HPC)系統。

一、Slurm API

Slurm提供了一組API,用於用戶和管理員使用編程語言進行訪問和管理Slurm,這些API包括C、Python、Perl和Java等語言。Slurm API包括以下組件:

  • 命令行界面:提供Slurm標準命令的Python介面;
  • Slurm open-source source base library:提供訪問Slurm API的C函數;
  • SLURM perl library:Slurm Perl API
  • Java binding:提供Java API的通用綁定(JNI);
  • Python binding:Slurm的Python API

所有Slurm API都可以在Slurm官方文檔中找到。這些API可用於創建自定義腳本,以管理Slurm工作,以及進行高級任務請求。

二、Slurm搭建GPU集群

在Slurm中使用GPU資源時,需要至少一個GPU,而對於多GPU節點,Slurm提供了多種排隊策略:

  • 共享GPU:可將同一任務的多個執行互相共享GPU。可以選擇合適的分區大小,該分區大小建議為每個GPU配置的核心數量;
  • 獨佔GPU:預訂所有GPU資源,等待隊列中的作業獲得所有GPU,生命周期結束後,釋放GPU資源;
  • 混合GPU:為同一任務使用多個GPU和CPU資源。Slurm將GPU、CPU和內存分開進行排隊,因此可以分別通過QoS參數控制GPU、CPU和內存。這意味著Slurm可以優化內存和GPU之間的通信。

以下是一個Slurm搭建GPU集群的示例,該示例使用2個節點,每個節點有1個GPU。

Step 1:安裝GPU驅動程序

$ sudo apt-get install nvidia-driver

Step 2:安裝CUDA和cuDNN

$ sudo apt-get install cuda
$ sudo apt-get install libcudnn7
$ sudo apt-get install libcudnn7-dev

Step 3:安裝Slurm

$ sudo apt-get install slurm-llnl

Step 4:在Slurm配置中添加GPU資源

在Slurm配置文件中定義GPU資源,如下所示:

NodeName=node1 Name=gpu Type=gpu File=/dev/nvidia0
NodeName=node2 Name=gpu Type=gpu File=/dev/nvidia0

Step 5:測試GPU資源

$ salloc -N 1 -p gpu -t 20:00
$ srun -p gpu -N 1 nvidia-smi

三、Slurm支持Ubuntu嗎

Slurm可以在各種Linux和Unix操作系統上運行,包括Ubuntu。可以使用以下命令在Ubuntu上安裝Slurm:

$ sudo apt-get install slurm-llnl

默認情況下,Slurm將在Ubuntu上啟動,並可以使用Ubuntu上的Slurm命令管理計算集群。

四、Slurm節點宕機處理

Slurm可以檢測到節點宕機並處理宕機節點。當一個節點宕機時,Slurm將執行以下操作:

  • Slurm將檢測到節點已經下線,並在Slurm資料庫中刪除該節點;
  • Slurm將自動停止正在運行的任務,並將它們重新分配到其它可用節點上;
  • Slurm將自動關閉所有由該節點處理的依賴任務,確保任務不會一直處於等待狀態。

如果您想要手動將節點從Slurm中刪除,可以使用以下命令:

$ scontrol update nodename=node0 state=down reason="node down"

以上就是Slurm的簡要概述,同時介紹了Slurm的幾個方面。隨著科學技術的發展,Slurm作為一個高效的計算集群管理系統在科學研究中扮演著巨大的角色。如有興趣可以進入官網(http://slurm.schedmd.com/)獲取更多資料。

原創文章,作者:小藍,如若轉載,請註明出處:https://www.506064.com/zh-tw/n/275970.html

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