導讀:2022年度科學突破獎(BreakthroughPrize)公布獲獎名單,六名科學家斬獲「生命科學科學突破獎」,包括開發二代DNA測序技術(Solexa測序)的ShankarBalasubramanian、David Klenerman和Pascal Mayer三位科學家,如果沒有由三名科學家發明的下一代基因測序技術,人類幾乎不可能立即識別和表徵新冠病毒、快速開發疫苗以及實時監測新的變異病毒。
高通量測序技術(NGS)又被稱為第二代基因測序技術,具有高輸出量以及高解析度等優勢,能夠迅速讀取序列,在提供豐富的遺傳學信息的同時,還能夠起到縮短測序時間的作用。
來自劍橋大學Shankar Balasubramanian、David Klenerman和Pascal Mayer三名科學家在1998年開發出了俗稱Solexa Sequencing的DNA測序方法,作為二代DNA測序技術與基於Sanger法的DNA測序手法想比,具有壓倒性的優勢,比如測序速度快,可以自動測序,並且價格低廉,準確簡便,並且多個DNA鏈可以同時並行的進行解析。

Shankar Balasubramanian(左)、David Klenerman(中)、Pascal Mayer(右)
這項新的DNA測序技術(Solexa測序)被劍橋大學的衍生公司(Solexa公司)進行了商業化,用於基因組學應用,包括人類基因組測序。Illumina於2006年收購Solexa公司,獲得新一代高通量測序技術,從而成為目前市場上的主流測序技術公司,所佔市場份額達80%。因為收購Solexa,也成為Illumina的轉折點,從此踏上高速發展的道路。
隨後2008年,新一代測序技術在人類個體基因組的開創性應用被公布。研究分別報道了一名非裔個體和一名亞裔個體的基因組。在這兩項研究中,研究人員使用了Solexa測序的下一代測序技術,這一技術是目前Illumina公司短讀測序儀的基礎。第一版人類基因組圖譜耗資30億美元,耗時十幾年。而使用下一代測序技術,在2008年可以在幾周內完成一個人類基因組的測序工作,同時該項技術還將一個人類基因組的測序成本降低到50萬美元。
如今,NGS技術下的人類基因組測序時間可以被壓縮到僅有一天,成本600美元。這一技術徹底改變了生物學,也讓我們能夠快速進行基因測序,加快了生物學和醫學的發展。
而大流行病期間,二代基因測序儀器用於新冠病毒檢測中,可快速、準確檢測臨床樣本並輸出龐大的基因組數據,指導新冠病毒防治比如預防措施制定、核酸試劑盒及疫苗研發、藥物研究等。同時,在監測病毒變異、病毒傳染路徑等方面。在這些領域,高通量基因測序儀具有它獨特的優勢,可以一次測出更多數據,而這些數據對於治療方式的研發、迭代具有指導作用。
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