基因

一、安裝和載入limma包 Limma是一款R軟件的包，可用於在微陣列和RNA-Seq下處理基因表達數據。首先，我們需要安裝limma包。代碼如下： if (!requireNam…

ABP-454基因編組設備旨在將高通量DNA測序技術帶入生物學實驗室，並為廣泛的應用提供一個平台。這篇文章將從多個方面深入探討ABP-454基因編組的技術細節、數據解析和結果分析，…

一、基因id轉換名稱 在基因id轉換過程中，最基本的是將基因id轉換為對應的基因名稱。 以下是Python代碼示例： import requests gene_id = “ENSM…

一、ArrayExpress簡介 ArrayExpress是一個功能強大的基因表達數據分析平台，對於生物醫學研究有着至關重要的地位。它由歐洲生物信息研究所（EMBL-EBI）創建並…

基因演化樹是比較不同生物個體基因信息相似性的一種可視化圖形。RAxML是一種經典的生成基因演化樹的軟件。RAxML在多個方面提供了所有已知的功能和選項以滿足用戶需要。本文將從RAx…

一、amplicon 的定義和基本概念 Amplicon 是 DNA 序列上的特定片段，通常是引物擴增反應得到的 DNA 片段。由於擴增反應中使用一對引物，因此得到的 amplic…

一、基因號怎麼查 基因號是指基因的唯一標識，也稱為基因ID或GenBank ID。在不同的數據庫中查詢基因號也有不同的方法。 1、NCBI(GenBank)數據庫：在NCBI數據庫…

一、Annovar使用 Annovar是一個廣泛使用的基因注釋分析工具，可用於處理各種生物信息學應用。簡單來說，使用Annovar可以輕鬆地將基因變異的信息與現有的數據庫進行比較，…

一、基礎概念 差異基因指在不同條件下基因表達水平差異顯著的基因。通過差異基因分析，可以篩選出在不同組之間有顯著差異的基因，進而分析差異基因的功能和通路，揭示其對於生物學過程的影響。…

一、基因家族分析是什麼 基因家族分析，指對某人的基因組進行全面的、高通量的檢測，並結合家族史、疾病史等信息，來進行個性化的健康風險評估和指導。 與傳統的基因檢測不同，基因家族分析是…

一、基因相關性分析圖怎麼看 在基因相關性分析中，一張圖像可以展示兩個基因之間的相關性。 通常使用散點圖x軸表示一個基因的表達量，y軸表示另一個基因的表達量，點的分佈越呈現出一條直線…

一、背景介紹 差異表達基因(differentially expressed genes, DEGs)指的是在不同樣本之間表達量顯著不同的基因。區分出這些基因對於深入了解物種內部基…

一、基因功能注釋的概念 基因功能注釋（Gene function annotation）是指根據基因序列來推斷該基因編碼的蛋白質或非編碼RNA的生物學功能的過程。對基因進行功能注釋…