基因
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使用bioconductorlimma进行基因表达数据分析
一、安装和载入limma包 Limma是一款R软件的包,可用于在微阵列和RNA-Seq下处理基因表达数据。首先,我们需要安装limma包。代码如下: if (!requireNam…
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深入了解ABP-454基因编组
ABP-454基因编组设备旨在将高通量DNA测序技术带入生物学实验室,并为广泛的应用提供一个平台。这篇文章将从多个方面深入探讨ABP-454基因编组的技术细节、数据解析和结果分析,…
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基因id转换
一、基因id转换名称 在基因id转换过程中,最基本的是将基因id转换为对应的基因名称。 以下是Python代码示例: import requests gene_id = “ENSM…
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ArrayExpress:基因表达数据的函数分析平台
一、ArrayExpress简介 ArrayExpress是一个功能强大的基因表达数据分析平台,对于生物医学研究有着至关重要的地位。它由欧洲生物信息研究所(EMBL-EBI)创建并…
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RAxML——构建高效的基因演化树
基因演化树是比较不同生物个体基因信息相似性的一种可视化图形。RAxML是一种经典的生成基因演化树的软件。RAxML在多个方面提供了所有已知的功能和选项以满足用户需要。本文将从RAx…
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Amplicon:基因分析中的重要工具
一、amplicon 的定义和基本概念 Amplicon 是 DNA 序列上的特定片段,通常是引物扩增反应得到的 DNA 片段。由于扩增反应中使用一对引物,因此得到的 amplic…
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基因ID号怎么查
一、基因号怎么查 基因号是指基因的唯一标识,也称为基因ID或GenBank ID。在不同的数据库中查询基因号也有不同的方法。 1、NCBI(GenBank)数据库:在NCBI数据库…
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Annovar:基因注释分析工具
一、Annovar使用 Annovar是一个广泛使用的基因注释分析工具,可用于处理各种生物信息学应用。简单来说,使用Annovar可以轻松地将基因变异的信息与现有的数据库进行比较,…
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差异基因分析
一、基础概念 差异基因指在不同条件下基因表达水平差异显著的基因。通过差异基因分析,可以筛选出在不同组之间有显著差异的基因,进而分析差异基因的功能和通路,揭示其对于生物学过程的影响。…
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基因家族分析:探索遗传信息,解锁健康密码
一、基因家族分析是什么 基因家族分析,指对某人的基因组进行全面的、高通量的检测,并结合家族史、疾病史等信息,来进行个性化的健康风险评估和指导。 与传统的基因检测不同,基因家族分析是…
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基因相关性分析
一、基因相关性分析图怎么看 在基因相关性分析中,一张图像可以展示两个基因之间的相关性。 通常使用散点图x轴表示一个基因的表达量,y轴表示另一个基因的表达量,点的分布越呈现出一条直线…
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差异表达基因研究
一、背景介绍 差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)指的是在不同样本之间表达量显著不同的基因。区分出这些基因对于深入了解物种内部基…
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基因功能注释的多个方面详细阐述
一、基因功能注释的概念 基因功能注释(Gene function annotation)是指根据基因序列来推断该基因编码的蛋白质或非编码RNA的生物学功能的过程。对基因进行功能注释…